A ideia aqui é desenvolver uma arquitetura de diretórios onde teremos apenas o template do nosso sistema disponível na internet.
De forma mais prática temos:
ROOT
+
|---+/core
!---+/admin
+---+/public_html -> arquivo de nosso template
Para colocar a arquitetura de diretórios acima em prática devemos criar um Rewrite no Apache, então teremos:
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteRule ^(.*)$ public/$1 [L]
</IfModule>